MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 25737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012811	TTG	2	6	309152	309157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240142057
5002	NC_012811	CGGAC	2	10	309165	309174	20 %	0 %	40 %	40 %	240142057
5003	NC_012811	CTC	2	6	309229	309234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142057
5004	NC_012811	CGGGA	2	10	309252	309261	20 %	0 %	60 %	20 %	240142057
5005	NC_012811	GC	3	6	309342	309347	0 %	0 %	50 %	50 %	240142057
5006	NC_012811	GC	3	6	309351	309356	0 %	0 %	50 %	50 %	240142057
5007	NC_012811	GATC	2	8	309908	309915	25 %	25 %	25 %	25 %	240142058
5008	NC_012811	GC	3	6	309952	309957	0 %	0 %	50 %	50 %	240142058
5009	NC_012811	CTC	2	6	309987	309992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142058
5010	NC_012811	CGA	2	6	310001	310006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142058
5011	NC_012811	TCG	2	6	310045	310050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142058
5012	NC_012811	CGA	2	6	310074	310079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142058
5013	NC_012811	CCCG	2	8	310155	310162	0 %	0 %	25 %	75 %	240142058
5014	NC_012811	TCA	2	6	310244	310249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142058
5015	NC_012811	CGG	2	6	310343	310348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142058
5016	NC_012811	GTC	2	6	310353	310358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142058
5017	NC_012811	CGT	2	6	310379	310384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142058
5018	NC_012811	CGC	2	6	310397	310402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142058
5019	NC_012811	GC	3	6	310419	310424	0 %	0 %	50 %	50 %	240142058
5020	NC_012811	GAGC	2	8	310464	310471	25 %	0 %	50 %	25 %	240142058
5021	NC_012811	CAT	2	6	310648	310653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142059
5022	NC_012811	CGC	2	6	310675	310680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142059
5023	NC_012811	CCG	2	6	310734	310739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142059
5024	NC_012811	GGC	2	6	310753	310758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142059
5025	NC_012811	TCA	2	6	310836	310841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142059
5026	NC_012811	GCC	2	6	310877	310882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142059
5027	NC_012811	CTG	2	6	310924	310929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142059
5028	NC_012811	TTG	2	6	310978	310983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240142059
5029	NC_012811	CCGC	2	8	311053	311060	0 %	0 %	25 %	75 %	240142060
5030	NC_012811	CAA	2	6	311084	311089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240142060
5031	NC_012811	CAGC	2	8	311126	311133	25 %	0 %	25 %	50 %	240142060
5032	NC_012811	CGC	2	6	311276	311281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142060
5033	NC_012811	CGC	2	6	311345	311350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142060
5034	NC_012811	CAG	2	6	311493	311498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142060
5035	NC_012811	CCTCG	2	10	311509	311518	0 %	20 %	20 %	60 %	240142060
5036	NC_012811	ATG	2	6	311531	311536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142060
5037	NC_012811	CGT	2	6	311539	311544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142061
5038	NC_012811	CGT	2	6	311620	311625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142061
5039	NC_012811	CCGA	2	8	311673	311680	25 %	0 %	25 %	50 %	240142061
5040	NC_012811	CGA	2	6	311746	311751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142061
5041	NC_012811	ACT	2	6	311770	311775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142061
5042	NC_012811	TGG	2	6	311817	311822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142061
5043	NC_012811	CCT	2	6	311872	311877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142061
5044	NC_012811	AGG	2	6	311904	311909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142061
5045	NC_012811	CGT	2	6	311920	311925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142061
5046	NC_012811	CGA	2	6	311926	311931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142061
5047	NC_012811	GGT	2	6	312133	312138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142062
5048	NC_012811	CACCTT	2	12	312160	312171	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	240142062
5049	NC_012811	TCA	3	9	312180	312188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142062
5050	NC_012811	GCT	2	6	312193	312198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5051	NC_012811	CGA	2	6	312202	312207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5052	NC_012811	TTC	2	6	312215	312220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142062
5053	NC_012811	TCGC	2	8	312240	312247	0 %	25 %	25 %	50 %	240142062
5054	NC_012811	GCG	2	6	312252	312257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142062
5055	NC_012811	CTG	2	6	312269	312274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5056	NC_012811	CTG	2	6	312290	312295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5057	NC_012811	GCC	2	6	312299	312304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142062
5058	NC_012811	ACG	2	6	312324	312329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5059	NC_012811	GGC	2	6	312331	312336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142062
5060	NC_012811	CCT	2	6	312337	312342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142062
5061	NC_012811	CGG	2	6	312390	312395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142062
5062	NC_012811	CGA	2	6	312438	312443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5063	NC_012811	CTT	2	6	312490	312495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142062
5064	NC_012811	CGC	2	6	312517	312522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142062
5065	NC_012811	TGG	2	6	312564	312569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142062
5066	NC_012811	GCCAC	2	10	312631	312640	20 %	0 %	20 %	60 %	240142062
5067	NC_012811	GGC	2	6	312667	312672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142062
5068	NC_012811	CTC	2	6	312680	312685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142062
5069	NC_012811	CTG	3	9	312689	312697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5070	NC_012811	GGT	2	6	312739	312744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142062
5071	NC_012811	GAA	2	6	312880	312885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240142062
5072	NC_012811	TCG	2	6	312945	312950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5073	NC_012811	CCA	2	6	312951	312956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142062
5074	NC_012811	CGC	3	9	312970	312978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142062
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5078	NC_012811	TC	3	6	313051	313056	0 %	50 %	0 %	50 %	240142062
5079	NC_012811	CGC	2	6	313224	313229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142062
5080	NC_012811	TGC	2	6	313233	313238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142062
5081	NC_012811	CG	3	6	313395	313400	0 %	0 %	50 %	50 %	240142063
5082	NC_012811	CTC	2	6	313474	313479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142063
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5084	NC_012811	GGA	2	6	313543	313548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142063
5085	NC_012811	GC	3	6	313602	313607	0 %	0 %	50 %	50 %	240142063
5086	NC_012811	CCCT	2	8	313609	313616	0 %	25 %	0 %	75 %	240142063
5087	NC_012811	CGCC	2	8	313695	313702	0 %	0 %	25 %	75 %	240142063
5088	NC_012811	GTCCG	2	10	313735	313744	0 %	20 %	40 %	40 %	240142063
5089	NC_012811	GCT	2	6	313833	313838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142063
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5091	NC_012811	GGC	2	6	313924	313929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142063
5092	NC_012811	GAT	2	6	313968	313973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142063
5093	NC_012811	CGT	2	6	314004	314009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142063
5094	NC_012811	GGC	2	6	314014	314019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142063
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5099	NC_012811	GAG	2	6	314116	314121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142063
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5101	NC_012811	CGT	2	6	314202	314207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142063
5102	NC_012811	CGT	2	6	314292	314297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142063
5103	NC_012811	CGC	2	6	314298	314303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142063
5104	NC_012811	CGA	2	6	314323	314328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142063
5105	NC_012811	GGATG	2	10	314330	314339	20 %	20 %	60 %	0 %	240142063
5106	NC_012811	GCG	2	6	314367	314372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142063
5107	NC_012811	CG	3	6	314457	314462	0 %	0 %	50 %	50 %	240142063
5108	NC_012811	TCG	2	6	314474	314479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142063
5109	NC_012811	TCG	2	6	314492	314497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142063
5110	NC_012811	TCCAC	2	10	314505	314514	20 %	20 %	0 %	60 %	240142063
5111	NC_012811	ACC	2	6	314546	314551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142063
5112	NC_012811	T	6	6	314813	314818	0 %	100 %	0 %	0 %	240142064
5113	NC_012811	CAAG	2	8	314901	314908	50 %	0 %	25 %	25 %	240142064
5114	NC_012811	ATC	2	6	314920	314925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142064
5115	NC_012811	GGGA	2	8	314970	314977	25 %	0 %	75 %	0 %	240142064
5116	NC_012811	CGA	2	6	315048	315053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142064
5117	NC_012811	CGA	2	6	315156	315161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142064
5118	NC_012811	CAGG	2	8	315187	315194	25 %	0 %	50 %	25 %	240142064
5119	NC_012811	GCG	2	6	315219	315224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142064
5120	NC_012811	CGAC	2	8	315263	315270	25 %	0 %	25 %	50 %	240142064
5121	NC_012811	CGTTC	2	10	315384	315393	0 %	40 %	20 %	40 %	240142064
5122	NC_012811	TCG	2	6	315446	315451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142064
5123	NC_012811	CG	3	6	315456	315461	0 %	0 %	50 %	50 %	240142064
5124	NC_012811	GCG	2	6	315483	315488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142064
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5155	NC_012811	TCC	2	6	317211	317216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142065
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5232	NC_012811	ACT	2	6	326275	326280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240142070
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5234	NC_012811	CTC	2	6	326407	326412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142070
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5240	NC_012811	TCG	2	6	326747	326752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142070
5241	NC_012811	CGA	2	6	326755	326760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142070
5242	NC_012811	CGG	2	6	326871	326876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142070
5243	NC_012811	CCG	2	6	326895	326900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142070
5244	NC_012811	GTC	2	6	326956	326961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142070
5245	NC_012811	GCC	2	6	326962	326967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142070
5246	NC_012811	GCC	2	6	326989	326994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142070
5247	NC_012811	CCG	2	6	327018	327023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142070
5248	NC_012811	CGA	2	6	327027	327032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142070
5249	NC_012811	ATGAAC	2	12	327068	327079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	240142070
5250	NC_012811	TG	3	6	327186	327191	0 %	50 %	50 %	0 %	240142070
5251	NC_012811	GAA	2	6	327211	327216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240142070
5252	NC_012811	GCCA	2	8	327226	327233	25 %	0 %	25 %	50 %	240142070
5253	NC_012811	CCT	2	6	327260	327265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142070
5254	NC_012811	C	6	6	327280	327285	0 %	0 %	0 %	100 %	240142070
5255	NC_012811	TGT	2	6	327300	327305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240142070
5256	NC_012811	GCTCCA	2	12	327332	327343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240142070
5257	NC_012811	TCG	2	6	327404	327409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142070
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5260	NC_012811	GTA	2	6	327457	327462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142070
5261	NC_012811	TCG	2	6	331448	331453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142071
5262	NC_012811	GCC	2	6	331524	331529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142071
5263	NC_012811	GGC	2	6	331604	331609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142071
5264	NC_012811	GCCACG	2	12	331621	331632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	240142071
5265	NC_012811	CGG	3	9	331651	331659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142071
5266	NC_012811	CTG	2	6	331666	331671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142071
5267	NC_012811	GCC	2	6	331700	331705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142071
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5269	NC_012811	ATGG	2	8	331805	331812	25 %	25 %	50 %	0 %	240142071
5270	NC_012811	GACG	2	8	331829	331836	25 %	0 %	50 %	25 %	240142071
5271	NC_012811	TTC	2	6	331862	331867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142071
5272	NC_012811	TCC	2	6	331891	331896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142071
5273	NC_012811	CGAAAT	2	12	332007	332018	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	240142071
5274	NC_012811	GTCGA	2	10	332026	332035	20 %	20 %	40 %	20 %	240142071
5275	NC_012811	TCGCA	2	10	332055	332064	20 %	20 %	20 %	40 %	240142071
5276	NC_012811	CCTC	2	8	332111	332118	0 %	25 %	0 %	75 %	240142072
5277	NC_012811	TCC	2	6	332139	332144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142072
5278	NC_012811	CAGC	2	8	332176	332183	25 %	0 %	25 %	50 %	240142072
5279	NC_012811	CG	3	6	332228	332233	0 %	0 %	50 %	50 %	240142072
5280	NC_012811	TCG	2	6	332265	332270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142072
5281	NC_012811	GCG	2	6	332300	332305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142072
5282	NC_012811	GCC	2	6	332335	332340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142072
5283	NC_012811	CTC	2	6	332342	332347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142072
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5285	NC_012811	GAG	2	6	332390	332395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142072
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5290	NC_012811	GCCC	2	8	332551	332558	0 %	0 %	25 %	75 %	240142072
5291	NC_012811	CGA	2	6	332566	332571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142072
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5295	NC_012811	GCGA	2	8	332772	332779	25 %	0 %	50 %	25 %	240142072
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5314	NC_012811	CCA	2	6	333637	333642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142074
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5319	NC_012811	GATG	2	8	333865	333872	25 %	25 %	50 %	0 %	240142074
5320	NC_012811	CCG	2	6	333891	333896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142074
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5322	NC_012811	TCC	2	6	333911	333916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142074
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5336	NC_012811	CGA	2	6	334542	334547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142074
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5346	NC_012811	ACG	2	6	334801	334806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142075
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5351	NC_012811	CCCT	2	8	334977	334984	0 %	25 %	0 %	75 %	240142076
5352	NC_012811	TCG	2	6	334986	334991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142076
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5357	NC_012811	CGT	2	6	335110	335115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142076
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5360	NC_012811	CGA	2	6	335224	335229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142076
5361	NC_012811	CGG	2	6	335269	335274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142076
5362	NC_012811	CGA	2	6	335330	335335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142076
5363	NC_012811	TCG	2	6	335427	335432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142076
5364	NC_012811	CGG	2	6	335458	335463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142076
5365	NC_012811	ACG	2	6	335472	335477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142076
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5368	NC_012811	TCG	2	6	335559	335564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142076
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5396	NC_012811	CGG	2	6	336649	336654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142079
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5479	NC_012811	CGCCA	2	10	339809	339818	20 %	0 %	20 %	60 %	240142082
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5483	NC_012811	CG	4	8	339918	339925	0 %	0 %	50 %	50 %	240142082
5484	NC_012811	CAA	2	6	339934	339939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240142082
5485	NC_012811	CGT	2	6	339982	339987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142082
5486	NC_012811	TCG	2	6	340026	340031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142082
5487	NC_012811	GCC	2	6	340043	340048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142082
5488	NC_012811	CCG	2	6	340060	340065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142082
5489	NC_012811	ACG	2	6	340086	340091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142082
5490	NC_012811	CTG	2	6	340094	340099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142082
5491	NC_012811	GAG	2	6	340160	340165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142082
5492	NC_012811	CGA	2	6	340174	340179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142082
5493	NC_012811	GC	4	8	340216	340223	0 %	0 %	50 %	50 %	240142082
5494	NC_012811	ACG	2	6	340233	340238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142082
5495	NC_012811	TCG	2	6	340251	340256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142082
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5499	NC_012811	CG	4	8	340428	340435	0 %	0 %	50 %	50 %	240142082
5500	NC_012811	TC	3	6	340440	340445	0 %	50 %	0 %	50 %	240142082

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